中国医学科学院阜外医院始建于1956年，是国家级三级甲等心血管病专科医院，也是国家心血管病中心、心血管疾病国家重点实验室、国家心血管疾病临床医学研究中心所在地。医院形成“中心—医院”一体化格局，分为临床医疗区（阜成门外院区）和预防研究区（门头沟西山园区），总编制床位1521张，实际开放1279张，在职员工3380人，拥有院士6人。

在临床规模与技术方面，中国医学科学院阜外医院已成为世界上最大的心血管疾病诊治中心。据临床统计，该院年门诊量74.5万人次，住院外科手术1.4万余例，内科介入手术4.9万余例，射频消融6433例，永久起搏器植入2283例。该院出院患者平均住院日仅6.8天，死亡率0.2%，在北京地区多项医疗质量评比中均排名第一。在复旦大学医院管理研究所发布的《中国最佳医院专科声誉排行榜》中，该院心血管病、心外科均连续九年蝉联第一。

中国医学科学院阜外医院在心血管诊疗技术创新方面成就卓著。建院以来，先后开展国内第一例室壁瘤切除术、冠状动脉搭桥术、急性心肌梗死冠状动脉内溶栓治疗等多项首创技术。近年来，该院开展国内首个可植入式人工心脏临床试验、国产自主研发第三代全磁悬浮人工心脏、亚洲首例经皮左室辅助、国内首例无导线起搏器植入，并在国际上首创多项一站式杂交技术治疗冠心病、先心病、大血管病。在国际上首次采用3D打印技术经皮穿刺下腔型房间隔缺损封堵术，将中国心血管病治疗提升至国际领先水平。

中国医学科学院阜外医院现拥有2个国家重点实验室、2个部级重点实验室、2个北京市重点实验室。自建院以来共获科研成果324项，其中国家科技进步奖43项。2014至2018年，该院连续五年在中国医院科技影响力心血管专科领域排名第一。医院还承担着全国心血管病防治工作，2004年卫生部心血管病防治研究中心落户该院，2013年国家心血管病中心投入实质运营。